Dit lab is in 1994 opgericht en is begonnen met vijf enthousiaste medewerkers. Hoe zijn deze enthousiaste mensen bij elkaar gekomen? Dit is allemaal naar aanleiding van het intreden van een nieuwe wet. Voor 1994 was er niet vastgelegd wanneer verdachten moesten meewerken aan het afstaan van DNA voor het onderzoek. Na problemen in zaken waarbij verdachten weigerden werd een wet ingevoerd die verdachten dwingt om DNA af te staan. Maar wanneer iemand verplicht wordt om DNA af te staan moet die persoon ook zelf een onafhankelijk onderzoek kunnen aanvragen voor zijn verdediging. Het probleem was dat er naast het Nederlands Forensisch Instituut (NFI) geen ander forensisch lab was die onder accreditatie aan deze zaken mag werken. Daarom is in 1994 het Forensisch Laboratorium voor DNA-Onderzoek (FLDO) opgestart. Het FLDO is begonnen als contra-laboratorium voor het onderzoek van de verdediging van de verdachte. Waar gedacht werd dat de zaken zouden binnenstromen gebeurde dit echter mondjesmaat. Met deze extra tijd zijn de medewerkers niet stil gaan zitten, maar zo zijn meerdere baanbrekende onderzoeken gestart. Dit zijn onder andere de Y-STR’s, mtDNA sequencing en MPS. Deze onderzoeken bleken een gat in de markt, omdat geen ander lab hier de middelen voor had. Hierdoor heeft het FLDO zichzelf definitief op de kaart gezet als innoverend forensisch laboratorium.
Het lab is daarom uitgegroeid tot niet alleen contra-onderzoeken, maar ook aanvullend DNA-onderzoek. Wat er ook voor zorgde dat er behoefte was naar meer mankracht. Het lab is nu verdubbeld in het aantal enthousiaste medewerkers.